Manajemen Sample Pemeriksaan Covid-19

Manajemen Sampel Covid-19

Tipe Spesimen dan Prioritas:

Untuk pengujian diagnostik awal COVID-19, CDC merekomendasikan pengumpulan dan pengujian menggunakan spesimen pernapasan atas, dalam hal ini usap (swab) nasofaring (NP). Ketika pengumpulan swab nasofaring tidak memungkinkan, berikut ini adalah alternatif lainnya:

1. Spesimen oropharyngeal (OP) yang dikumpulkan oleh tenaga kesehatan profesional, atau
2. Swab nasal mid-turbinate (NMT) atau tengah hidung yang dikumpulkan oleh tenaga kesehatan profesional atau dengan pengambilan sendiri di tempat (menggunakan flocked swab), atau
3. Spesimen nares anterior (NS) (depan hidung) yang dikumpulkan oleh tenaga kesehatan profesional atau dengan pengambilan sendiri di lokasi (menggunakan swab busa bundar).

Untuk NS, swab poliester tunggal dengan poros plastik harus digunakan untuk kedua nares. Swab NS atau NMT harus ditempatkan dalam tabung transport yang mengandung media transport virus, Amies, atau saline steril. 

Jika NP dan OP dikumpulkan, keduanya harus digabung dalam satu tabung untuk memaksimalkan sensitivitas uji dan membatasi sumber daya pengujian.

CDC juga merekomendasikan pengujian spesimen saluran pernapasan bawah, jika ada. Untuk pasien yang mengalami batuk produktif, sputum harus dikumpulkan dan diuji untuk SARS-CoV-2. Induksi dahak tidak dianjurkan. Ketika diindikasikan secara klinis (mis., Mereka yang menerima ventilasi mekanis invasif), sampel aspirasi saluran pernapasan yang lebih rendah atau sampel lavage bronchoalveolar harus dikumpulkan dan diuji sebagai spesimen saluran pernapasan bawah.

Spesimen harus dikumpulkan sesegera mungkin setelah diambil untuk melakukan tes COVID-19, terlepas dari waktu onset gejala. Pertahankan kontrol infeksi yang tepat saat mengumpulkan spesimen.

Nasapharyngeal swab
(Sumber: https://www.cdc.gov/pertussis/clinical/diagnostic-testing/specimen-collection.html)

Pengumpulan Spesimen:

Saluran Pernapasan Atas

Swab nasofaring (NP) / swab orofaringeal (OP)

1. Persiapan alat dan bahan:

• Alat Pelindung Diri (APD) (masker, sarung tangan/handscoon, pelindung mata, baju pelindung). 
• Form permintaan dan label 
• Swab berserat sintetis dengan poros plastik. Jangan menggunakan swab kalsium alginat atau dengan poros kayu, karena mengandung zat yang dapat menonaktifkan beberapa virus dan menghambat pengujian PCR. 
• Kit Universal Transport Medium (UTM) (wadah transfer virus bertutup merah). Periksa tanggal kedaluwarsanya. Jika tidak ada Kit UTM bertutup merah, UTM bertutup biru dapat digunakan. 
• Wadah biohazard.

2. Jelaskan prosedur kepada pasien.

3. Cuci tangan. Kenakan APD.

4. Jika pasien memiliki banyak lendir di hidungnya, ini dapat mengganggu pengumpulan sel. Minta pasien menggunakan tisu untuk membersihkan lendir hidung yang terlihat sebelum swab diambil. 

5. Dudukan pasien di tempat tidur yang nyaman. Yang terbaik adalah jika pasien ditempatkan pada posisi tinggi di tempat tidur dengan bagian belakang kepala ditopang.

6. NP: Masukkan swab fleksibel beberapa sentimeter dengan gerakan lambat dan mantap ke dalam lubang hidung sejajar dengan langit-langit mulut. Swab harus mencapai kedalaman yang sama dengan jarak dari lubang hidung ke lubang luar telinga. Biarkan swab di tempat selama beberapa detik untuk menyerap sekresi. Hapus swab perlahan saat memutarnya. 

OP (mis., swab tenggorokan): swb faring posterior, hindari lidah.

7. Tempatkan swab segera ke dalam tabung steril yang mengandung 2-3 ml media pengangkut virus. Saat ini, CDC sekaran merekomendasikan hanya menggunakan swab NP. Jika kedua swab digunakan, spesimen NP dan OP harus digabungkan menjadi satu botol tunggal. Swab OP tetap merupakan jenis spesimen yang dapat diterima.

Aspirasi nasofaring atau nasal

1. Kumpulkan 2-3 mL ke dalam wadah pengumpul sputum yang steril, anti bocor, atau wadah kering steril.

Penanganan dan Pengiriman Spesimen:

1. Simpan spesimen pada suhu 2-8 ° C dan dikirim dalam waktu semalam menggunakan kotak es. 

2. Beri label setiap wadah spesimen dengan nomor ID pasien (mis., Nomor rekam medis), ID spesimen unik (mis., Nomor permintaan laboratorium), jenis spesimen (mis., Serum) dan tanggal sampel dikumpulkan.

Penyimpanan Spesimen:

1. Simpan spesimen pada suhu 2-8°C hingga 72 jam setelah pengumpulan. 

2. Jika terjadi penundaan dalam pengujian atau pengiriman, simpan spesimen pada -70°C atau lebih rendah.

Post Analitik (Interpretasi Hasil):

1. Hasil positif menunjukkan adanya RNA SARS-CoV-2; korelasi klinis dengan riwayat pasien dan informasi diagnostik lainnya diperlukan untuk menentukan status infeksi pasien. Hasil positif juga tidak mengesampingkan infeksi bakteri atau koinfeksi dengan virus lain. Agen yang terdeteksi mungkin bukan penyebab penyakit yang pasti. 

2. Hasil negatif tidak meniadakan infeksi SARS-CoV-2 dan tidak boleh digunakan sebagai dasar tunggal untuk keputusan manajemen pasien. Hasil negatif harus dikombinasikan dengan pengamatan klinis, riwayat pasien, dan informasi epidemiologis.

Oleh: C. Indriputri

Referensi:

1. Interim Guidelines for Collecting, Handling, and Testing Clinical Specimens from Persons for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). CDC. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/guidelines-clinical-specimens.html
2. LabCorp COVID-19 RT-PCR test EUA Summary. FDA. https://www.fda.gov/media/136151/download
3. COVID-19 Sample Collection Kits for Upper Respiratory Tract Specimens. Copanusa. 
4. https://www.copanusa.com/covid-19-sample-collection-kits-for-upper-respiratory-tract-specimens/
5. Standard method for detecting upper respiratory carriage of Streptococcus pneumoniae: Updated recommendations from the World Health Organization Pneumococcal Carriage Working Group. Satzke et al., https://www.researchgate.net/publication/260872062_Standard_method_for_detecting_upper_respiratory_carriage_of_Streptococcus_pneumoniae_Updated_recommendations_from_the_World_Health_Organization_Pneumococcal_Carriage_Working_Group.